Ævintýri Mario halda áfram í Super Mario Flash 2. Fyrra verkefni hans til að bjarga Peach prinsessu heppnaðist vel, en hetjan þurfti ekki að hvíla lengi á laurunum. Aumingja prinsessunni var aftur rænt og í þetta skiptið var það gert af dreka. Hann setti fangana í turninn og krefst algjörrar undirgefni frá Svepparíkinu. Mario hafði ekki enn haft tíma til að hvíla sig, en fór aftur á veginn. Í þetta skiptið mun hann þurfa að takast á við fleiri óvini, þeir munu ráðast í hópa. Vertu fljótur og lipur þegar þú hoppar á höfuð óvina þinna og eyðileggur þá í Super Mario Flash 2.
