Alvarleg hætta steðjar að borginni bráðlega verður hún fyrir árás risastórs, skelfilegs skrímsli, og ofurhetjan, sem er kölluð til að gæta öryggis bæjarbúa, finnur sig algjörlega máttlausan í Energy Superman 3D. Ofurhæfileiki hans er orkuboltar sem hann kastar í óvininn og getur þannig eyðilagt hann. En reglulega þarf hetjan að endurhlaða sig, sérstaklega ef daginn áður þurfti hann að nota orku sína. Í leiknum Energy Superman 3D er þetta nákvæmlega staðan og hetjan, áður en hún hittir óvininn, þarf að safna orku og í þessu muntu hjálpa hetjunni við endalínuna, smella á kvarðann svo að ofurhetjan ráðist á óvininn og sigrar hann í Energy Superman 3D.
