Ninjur komu fram í Japan á miðöldum og þjónuðu sem njósnarar, útsendarar og njósnarar. Þeir klæddust dökkum fötum, huldu andlit sín og voru að mestu aðgerðir á nóttunni, hreyfðu sig hljóðlaust og kláruðu úthlutað verkefni. Allar ninjur náðu tökum á list ninjutsu. Í meginatriðum eru ninjur tegund af kappi sem notuð eru í sérstökum aðgerðum, eins og japanska sérsveit. Hetju leiksins Ninja Speed Runner er einnig falið leynilegt verkefni, svo hann fer hratt. Shurikens fljúga á móti honum, þaðan sem hann verður að forðast og þú munt hjálpa honum með þetta og neyða hetjuna til að hoppa eða önda í Ninja Speed Runner.
