Þrátt fyrir að titill Mega Mario World 2 Awakened Power sé með hinn goðsagnakennda Mario, verður aðalpersóna leiksins í raun bróðir hans Luigi. Hann varð að klæðast hetjunni, þar sem Mario þurfti á síðustu stundu að fara til borgarinnar tútta, þar sem nokkur vandamál komu upp. Og á sama tíma birtist hinn illi Bowser og byrjaði að ógna svepparíkinu. Luigi hefur nú tækifæri til að sanna sig. Í langan tíma, eftir að vera í skugga fræga bróður síns, gat hann ekki gert þetta. Nú, með þinni hjálp, mun hetjan í grænu gallarnir geta tekist á við Bowser og fengið dýrðarstykkið sitt í Mega Mario World 2 Awakened Power.
