Gaur með ofurkrafta Köngulóarmannsins fór að þjóna í erlendum leyniþjónustum og gerðist sérstakur umboðsmaður eins og James Bond. En hann þarf ekki vopn; hann tekst á við óvini sína. Það sem losar vef úr boganum og flækir óvininn við hann, gerir hann algjörlega óhreyfðan. Í Mutant Assassin 3D muntu hjálpa hetjunni að ljúka verkefnum með því að útrýma óæskilegum umboðsmönnum óvinarins. Eyðingarkerfið er einfalt: þú miðar græna hringnum að næsta rauða illmenni og sleppir vefnum. Það vefst um líkamann og óvinurinn er sigraður. Á sama hátt þarftu að safna hrúgum af peningum, þeim verður að safna til að klára borðið í Mutant Assassin 3D.
