Glæpamenn kjósa ekki alltaf að bregðast við í skjóli myrkurs, þjófar starfa á fjölmennum stöðum og mest af öllu vilja þeir fremja svívirðingar sínar á lestarstöðvum, strætóstöðvum, flugvöllum og auðvitað neðanjarðarlestinni. Það er engin tilviljun að á slíkum stöðum eru skipulagðar sérstakar lögregludeildir sem rannsaka glæpi sem framdir eru á því yfirráðasvæði sem þeim er trúað fyrir. Hetjur leiksins Subway Sleuth: Olivia og John eru rannsóknarlögreglumenn. Ásamt þeim muntu rannsaka annað rán á erfiðustu neðanjarðarlestarstöðinni. Það virðist laða að þjófa og fjöldi glæpa á því fer í gegnum þakið. Það er kominn tími til að binda enda á þetta með því að hlutleysa glæpagengið sem stendur á bak við öll voðaverkin í Subway Sleuth.