Á hverju stigi munu nokkrar hetjur af gjörólíkum stigum birtast fyrir framan þig. Þetta gætu verið ósköp venjulegir krakkar eða stelpur, ofurhetjur og svo framvegis. Við upphaf Persona Runner muntu sjá þátttakanda sem þú verður að búa til það sem var sýnt þér fyrir hlaupið. Hetjan verður að safna einhverju sem mun auka rauða eða bláa litinn á kvarðanum. Fyrst ákveður þú hvaða litur ætti að vera ríkjandi og safnar aðeins því sem fær hann til að vaxa. Ef stig hans á endamarkinu er meira en helmingur mælikvarða yfir höfuð hetjunnar, muntu klára borðið. Og auðmjúki hlauparinn mun breytast í frábæra hetju í Persona Runner.
