Í núverandi stríðum er áherslan lögð á nútímatækni og flugskeyti af mismunandi drægni eru sérstaklega mikils virði. Þær verða sífellt nákvæmari og eyðileggjandi og þú verður að stjórna sumum tegundum eldflauga í Boom Missile 3D. Verkefnið er að ná skotmarki á eyjunni. Leyniþjónustur greindu frá og flokksmenn breyttu skotmarkinu. Allt sem þú þarft að gera er að miða eldflauginni og stjórna, þar sem óvinurinn mun reyna að skjóta það niður með hvaða hætti sem er. Allt sem flýgur til þín er ógn, jafnvel meinlausar blöðrur. Forðastu og farðu í átt að skotmarkinu þar til stór bada uppsveifla kemur. Á hverju stigi muntu ná skotmörkum af mismunandi erfiðleikum í Boom Missile 3D.