Hvítur fugl að nafni Bob flaug suður sem hluti af hjörðinni sinni, en þegar þeir flugu yfir borgina fékk fuglinn áhuga á því að sumir fuglar dvelja yfir veturinn og ætla ekki að fljúga. Hún ákvað að halda sig aðeins á bak við pakkann og spyrja hvers vegna þetta væri að gerast. Þegar hann lækkaði neðar var fuglinn umkringdur háhýsum og skelfdist og skelfing leiddi aldrei til neins góðs. Þú þarft að hjálpa fuglinum í Flappy Bob. Hún vill ekki lengur vita neitt, eina löngun hennar var að flýja úr steini borgarfrumskóginum og ná hjörðinni sinni. Það er mikilvægt að snerta ekki veggi og þök húsa í Flappy Bob og reyna að halda fuglinum á ákveðnu stigi.