Nokkrar frumgerðir voru búnar til í Matrix og reyndist ein þeirra, númer 09435, vera farsælust. Þetta er stafrænn drengur sem byrjaði að þroskast á ótrúlegan hátt hratt og fljótlega langaði hann til að skoða umheiminn. Hann fann leið til að yfirgefa fylkið og fór á leið til Prototype Guy. Höfundarnir ákváðu að hafa ekki áhrif á gaurinn, þeir biðja þig um að hjálpa honum að laga sig, yfirstíga hindranir. Það er nauðsynlegt að stökkva yfir beittum toppa og ferkantaða vélmenni. Við the vegur, vélmenni er hægt að eyða með því að hoppa beint ofan á þau. Ef hindruninni er ekki yfirstigið mun hetjan byrja aftur í Prototype Guy.
