Hin viðskiptalega og sjálfsörugga hetja leiksins Ninja Frog Runner er ninja froskur. Eftir að hafa bundið sárabindi á höfuðið ímyndar paddan sig ósigrandi og þú munt hjálpa til við að sanna það fyrir öllum sýndarheiminum. Til að gera þetta þarftu að fara alla leið og halda þér innan fimm mínútna mörkanna. Hetjunni verður hindrað á allan mögulegan hátt af ýmsum verum: ofsafengnum flugusvampum, óeðlilegum stökkandi bleikum héra og blár páfagaukur með risastóran gogg mun reyna að ráðast að ofan. Og þetta er bara byrjunin. Auk þess snúast beittar sagir á pöllunum, þar eru margar gryfjur með vatni eða hrauni. Safnaðu berjum, þar á meðal að brjóta brúna kubba í Ninja Frog Runner.
