Í stórri stórborg hafa orðið nokkur slys á leiðslunni sem vatn fer inn um borgina. Þú í leiknum Pipes: The Puzzle verður að gera við rör. Ákveðið svæði verður sýnilegt á skjánum fyrir framan þig. Lagnir verða neðanjarðar. Með músinni er hægt að snúa sumum þeirra í geimnum. Verkefni þitt er að afhjúpa rörin þannig að þau séu tengd hvort við annað. Um leið og öll leiðslan er komin í lag mun vatn renna í gegnum hana. Um leið og það kemur inn í borgina færðu stig í leiknum Pipes: The Puzzle og þú heldur áfram að gera við næsta hluta.