Mario er ekki áhugasamur um hrekkjavöku, því venjulega á þessum tíma eru allir illir andar virkjaðir í víðáttum Svepparíkisins og Bowser sleppir öllum handlöngum sínum til að gera óreiðu. Í Super Mario Flash Halloween Version, munt þú hjálpa Mario að finna öll illmennin og klára þau með því að hoppa að ofan. Allir vinir kappans og meira að segja bróðir Luigi fela sig heima og reka ekki nefið út, aðeins hugrakkir pípari er ekki hræddur við neinn. Og það er ástæða fyrir þessu - það ert þú, lipur leikmaðurinn, sem stjórnar hetjunni og lætur hann ekki gera mistök í Super Mario Flash Halloween Version.
