Í hinni langlyndu borg hafa vondu kallarnir snúið aftur í Naruto 3D Game. Bókstaflega daginn áður tók gula hetjan við Huggy-skrímslin og bæjarbúar andvarpuðu rólega, en leikfangaskrímslunum var skipt út fyrir illt fólk - svartar ninjur, og aðeins hetjan sem þú þekkir vel undir nafninu Naruto ræður við þau. Strákur í björtum samfestingum með gult hár sem stingur upp er tilbúinn að bjarga borginni aftur. Efst til hægri finnur þú kort þar sem ræningjar eru merktir með rauðum doppum. Notaðu ASDW örvarnar til að hreyfa hetjuna og um leið og þú finnur illmennið skaltu eyða honum, eins og Naruto kann. Smelltu á músarhnappinn og hetjan mun gera allt sjálf. Óvinurinn mun falla ef stöngin fyrir ofan höfuð hans hverfur í Naruto 3D leik.
