Í seinni hluta Ant Destroyer 2 þarftu aftur að berjast við maurana sem eru að reyna að fanga ákveðið svæði. Fyrir framan þig á skjánum muntu sjá leikvöllinn þar sem maurar munu birtast. Þeir munu skríða út frá mismunandi hliðum og hreyfast á mismunandi hraða. Verkefni þitt er ekki að láta þá yfirgefa íþróttavöllinn. Þú verður að íhuga allt vandlega og ákveða aðalmarkmiðin. Nú verður þú að smella á maurana að eigin vali með músinni. Þannig muntu bera kennsl á þau sem skotmörk og lemja maurana. Hvert slíkt högg mun eyða maurnum og þú færð stig fyrir það.