Í fjarlægum dásamlegum heimi lifa greindir ávextir. Eins og ég og þú, þá elska þeir íþróttir og skipuleggja oft margs konar keppnir. Karakterinn þinn Watermelon, sem mun taka þátt í hlaupakeppnum. Þú í leiknum Watermelon Run 3d mun hjálpa honum að vinna þá. Fyrir framan þig á skjánum muntu sjá karakterinn þinn sem mun smám saman ná hraða til að hlaupa meðfram hlaupabrettinu. Með því að nota stjórntakkana verður þú að láta Watermelon þinn hlaupa um ýmsar hindranir sem eru á vegi hans. Hetjan þín verður líka að stökkva yfir holur í jörðu og önnur hættuleg svæði á leið sinni. Ýmis konar ávöxtum verður dreift á veginum, sem þú verður að hjálpa Watermelon að safna og fá stig fyrir það.
