Það er orðin góð hefð fyrir ofurhetjum úr Marvel alheiminum að fara einar út gegn her ófreskja. Í Batman Commander hjálparðu Batman að hrinda árásum skrímsli úr geimnum. Mjög óþægilegar verur, svipaðar stórkostlegum goblins, munu ráðast bæði úr lofti og frá jörðu. Til að verða ekki auðvelt skot, mun hetjan vera á hreyfingu allan tímann, það er að hlaupa. Á flótta þarftu að skjóta á óvini sem eru að færast í átt að eða ráðast að ofan. Fimi og fimi er krafist af þér. Verkefnið er að fá hámarksfjölda stiga. Hetjan á þrjú líf, fjöldi þeirra endurspeglast í efra vinstra horninu. Þegar maður stendur frammi fyrir óvin, hverfur eitt líf í Batman Commander.
