Spider-Man hefur óvenjulega hluti að gerast stundum, og sérstaklega undanfarið. Hann getur sofnað heima hjá sér og vaknað á allt öðrum stað. Þetta er einhvers konar töfra eða ofurtækni, þú þarft að komast að því áður en það versnar. Í leiknum Marvel Ultimate Spider-man Mystery City finnur þú og ofurhetja þig í dularfullri borg sem er ekki á kortinu. Líklegast er hann í samhliða alheimi. Spider-Man vill skilja hvernig hann er fluttur í geimnum og hvers vegna nákvæmlega hér. Að flytja um borgina. Það er nauðsynlegt að hoppa og lenda nákvæmlega á bláu flísunum, annars getur hetjan meiðst í Marvel Ultimate Spider-man Mystery City.
