Í seinni hluta Funny Throat Surgery 2 muntu halda áfram að vinna sem tannlæknir á sjúkrahúsi. Sjúklingar með tannsjúkdóma koma til þín. Fyrst af öllu þarftu að rannsaka munnholið vandlega og greina sjúklinginn. Eftir það mun stjórnborð birtast þar sem ýmis lækningatæki og lyf verða sýnileg. Með því að nota þessa hluti stöðugt muntu framkvæma aðgerðir sem miða að því að meðhöndla sjúklinginn. Þegar þú ert búinn verður hann alveg heilbrigður og þú byrjar að meðhöndla aðra sjúklinga.