Billy er skepna sem kom til jarðar frá annarri plánetu. Skip hans missti stjórn á þyngdarafli sterkrar jarðar og hetjan varð að steypa í rúst. Hann féll beint í sjóinn og skynjaði strax hættuna. Það er vatn á plánetunni hans heima, en hann er sjálfur skepna, þó að hann geti fullkomlega synt undir vatni og andað. En á framandi plánetu er hann aðeins umkringdur óvinum og hann vill flýja héðan sem fyrst. Mini radar hans sýndi hvar skipið féll, kannski er hægt að laga það, en fyrst þarftu að komast að því. Það kemur í ljós að skipið féll líka í vatnið, en nokkur hundruð km frá þeim stað þar sem geimveran okkar er núna. Hjálpaðu honum að komast á staðinn, hann mun hreyfa sig mjög fljótt, og þú færir hann upp eða niður, fer eftir þeim hindrunum sem birtast í formi rándýrra fiska, Marglytta eða ígulkera. Safnaðu mynt og öðrum titlum til að fá tækifæri til að bæta getu hetjunnar í Run Billy Run.
