Hinn hugrakki Ninja Kyoto fékk verkefni frá yfirmanni skipunar sinnar til að komast inn í verndaða bú aristokrata og stela þaðan leyniskjölum. Þú í leiknum Endless Ninja mun hjálpa honum að klára þetta verkefni. Karakterinn þinn mun fara á leiðinni smám saman að ná hraða. Á leið sinni mun rekast á tegundir af gildrum. Hetjan þín sem nálgast þau verður að gera stökk undir handleiðslu þinni. Þannig mun það fljúga í loftinu í gegnum þessa hættulegu hluta vegarins. Stundum rekst á ýmis konar hluti og mynt sem dreifðir eru alls staðar. Þú verður að reyna að safna þeim öllum.
