Hugrakkur Ninja stríðsmaður fékk verkefni frá yfirmanni pöntunar sinnar. Persóna okkar verður að síast inn í ákveðna verndaða staði og stela fornum handritum þaðan. Þú í Ninja Ninja Jump mun hjálpa honum í þessum ævintýrum. Þú munt sjá persónu þína á ákveðnu svæði. Með því að nota stjórntakkana muntu láta hann hlaupa áfram. Stundum verður hetjan okkar að klifra upp á vegg eða hoppa yfir ýmsa dýfa í jörðu. Ýmsir hlutir sem þú þarft að safna munu dreifast um allt.
