Í nútíma heimi eru töluvert af banvænum vírusum sem valda dauða fyrir ýmsar lifandi verur. Í dag í Kill The Microbes verðurðu að berjast við nokkrar tegundir þeirra. Áður en þú á skjánum munt þú sjá nokkrar örverur staðsettar á mismunandi stöðum á íþróttavellinum. Þú verður að velja einn af þeim og smella á hann með músinni. Þannig sprautarðu lyfinu og lætur bakteríuna springa. Verk hennar sem falla í aðrar örverur munu tortíma þeim og þú færð stig fyrir þetta.