Í fjarlægri framtíð þróuðu vísindamenn sérstakt smáskip þar sem unnt var að eyðileggja vírusa af ýmsu tagi. Þú í leiknum Virus Hunter mun stjórna því. Áður en þú birtir þig á skjánum sérðu mannslíkamann sem þessi eining verður í. Hann mun fljúga áfram smám saman með hraða. Á leið sinni munu ýmsar bakteríur myndast. Þú verður að skjóta nákvæmlega frá sérstökum tækjum til að falla í þessar bakteríur og þannig eyða þeim.
