Langt á Norðurpólnum býr fjölskylda af fyndnum mörgæsum. Í dag verður einn þeirra að fara á ákveðið svæði til að veiða bragðgóður fisk þar. Þú í Penguin Run 3d leiknum mun hjálpa hetjunni okkar að komast þangað eins fljótt og auðið er. Áður en þú á skjánum mun persóna þín verða sýnileg, sem mun hlaupa fram á við brautina og smám saman öðlast hraða. Á leið sinni fer ýmsar hindranir og aðrar hættur í ljós. Með því að nota stjórntakkana verður þú að gera það svo að hetjan þín myndi komast framhjá þeim öllum eða stökkva yfir. Hjálpaðu honum einnig að safna ýmsum gagnlegum hlutum sem dreifðir eru alls staðar.
