Leyniumboðsmaðurinn Joni fékk fyrirmæli um að síast inn í ýmsar hernaðaraðgerðir óvina og stela leynilegri þróun þaðan. Þú í leiknum Johnny Megatone verður að hjálpa hetjunni okkar í þessum ævintýrum. Hetjan þín verður að fara um ýmsa staði. Á leiðinni verða staðsettar ýmsar gildrur og hindranir. Með því að nota stjórntakkana verðurðu að þvinga hetjuna þína til að hoppa yfir hluta gildranna eða neyða hann til að komast framhjá þeim. Ef þú hittir óvin, muntu taka þátt í baráttunni við þá og tortíma honum.
