Hver veit hvað er falið í djúpum hafsins, en jafnvel minna erum við kunnugur íbúum neðanjarðar hellum. Í leiknum Mutant Snake þú horfir á dýpt, sem er ekki enn í boði fyrir nútíma vísindamenn. Þar vaknaði stórt snákurstökkbrigði og vill flýja til yfirborðsins. Snákurinn ætti að drífa, vegna þess að skrímslið hreyfist miklu meira og sterkari og það vill borða karakterinn okkar. Í höndum þínum, líf sjaldgæfra veru sem getur breytt nokkrum vel þekktum kenningum um þróun lífvera. Hjálpa snáknum að fara leið sína meðfram vinda ganginum og flýta sér, eftir að öflugir kjálkar smella og reyna að grípa til halans.
